PASTA XML

Boa tarde. Desejo que a plataforma separe por pasta os XML baixados pelo padrão nacional, pelo autodoc, pois está acontecendo que os XML estão todos juntos dentro da mesma pasta cofre. Isso acaba ocasionando duplicidade de arquivos na hora da importação para domínio. Sendo que foi aconselhado desabilitar uma das partes. Isso para mim não é interessante, porque muitos dos meus clientes são mistos, quer dizer, alguns têm certificado digital, e outros não possuem.