Pesquisa por CNPJ com pontuações

Deve-se validar o CNPJ nas pesquisas mesmo com as pontuações, é muito complicado quando vamos fazer atualizações em muitos certificados de uma vez. Toda vez tenho que retirar os pontos e hífens quando quero pesquisar pelo CNPJ. Exemplo: 49.820.386/0001-77 --> 49820386000177(Só funciona dessa segunda forma)